成为摄政王后的好几个月里，夏华一直都忙着军队的整顿、改编事务，虽说“拥兵自重”的思想是不对的，但在眼下这种乱世里，把枪杆子牢牢地掌握在手里才是干其他事甚至保住自己性命的根本前提。整编军队的核心思想和主要大纲由夏华确定，将其加以补充完善以及将其付诸实际则由左宗棠和石达开负责。毫无疑问，目前的太平军一把手是夏华，二把手和三把手便是左宗棠和石达开了，对于左石二人，夏华是很了解的，左宗棠既擅长战略也擅长战术，历史上，左宗棠坚定地反对放弃新疆、认识到新疆陆防的重要性可证明他的战略头脑和战略目光，他亲自率军上阵收复新疆并且百战百胜则可证明他的战术手段石达开则是“长于战术，稍微短于战略”，历史上，石达开在天京变乱后出走单干，最终不但没有另起炉灶、自立门户，反而落得了全军覆没的结局，以及他固执地想要入川的举措，可证明他在战略上确实有些不足，另外，在打仗上，石达开擅长野战，稍微短于城市攻防战和攻坚战，历史上，石达开在出走单干后确实没能打下几个较大的城市。正所谓人无完人，石达开毕竟还很年轻，也没有接受过真正的现代化军事教育，能靠着与生俱来的军事天赋就能取得如此成就，也是十分了不起的了，假以时日，对其进行好好培养，随着时间的推移，他必定能成长为第二个左宗棠。为了牢牢地控制住全军、最大限度地铲除军队内部的山头派系、消除杨秀清等人的残余影响力、提升全军的战斗力，夏华、左宗棠、石达开按部就班地实施了以下的几大措施：

首先，全面裁军，去莠留良，精简人员，缩减臃肿冗杂的机构，贯彻“精兵路线”诸王军队里，夏华的明王军在“质量上”自然是最过硬的，正因为如此，夏华便有了对别王军队大削大减的充分理由。明王军几乎没有裁撤兵员，秦王军和唐王军也基本上没有被“动”，被裁撤的兵员都是来自东王军、西王军、北王军、汉王军以及隋王军捻军的。此项措施，堪称一箭双雕，既达到了“裁军精兵”的目的，也不动声色地削弱了东、西、北等王的旧部

其次，全面混编，全军缩减为2个师，不同师之间以“营”为单位地完全打乱再混合，如此一来，随着时间的推移，各部队越来越融合，原先的东王军、西王军、北王军、秦王军、汉王军、唐王军、明王军、隋王军这种身份、色彩、烙印将会随之越来越淡化，道理很简单：随便挑出一个师，该师有的营来自原明王军，有的营来自原东王军，有的营来自原隋王军等，完全地混编融合在一起，并且不只是该师的组成部队，该师的各级军官也打乱了，也是混合重组的，使得这个师自然就不好说还是哪个王的旧部军队了，它只是听命于夏华一个人的“新太平军”

第三，全军所有团长、副师长、师长等中高级军官的家人都必须定居在南京城内，夏华对其提供优厚待遇，表面上是给予嘉奖抚慰，实际上就是将其变相地扣押为人质，从而迫使某些心怀二意者不敢造次

第四，全军实施“本地军、异地兵”原则，具体是这样的：比如，某个师驻扎在江西省，但该师的基层士兵们却不完全是江西省本地人，恰恰相反，大部分士兵是外省人，如此一来，该师的高级军官如果试图割据自立，该师的基层士兵们肯定不会追随的，因为他们的家乡和家人都在外省，怎么可能愿意舍弃家人？这项原则的另一个体现是：假如，在山东省招募了一批新兵，这批新兵不会补充进驻扎在山东省的部队里，而是会补充进驻扎在别省的部队里。两者双管齐下，能十分有效地杜绝某支军队成为该军队主官私人军队的不良现象，防止割据

第五，提高官兵们的待遇。众所周知，在洪秀全、杨秀清统治时期，太平军官兵是不发军饷的，张乐行的捻军虽然不搞这一套，但捻军财力很有限，使得捻军官兵的待遇向来很低，如今，夏华掌权，他完全地废除了洪秀全的那一套，光明正大地恢复了军饷制，向全军官兵提供了十分优厚的待遇。作为参照，普通绿营兵一个月的军饷不到二两银子，普通湘军兵勇一个月的军饷达到四两多银子，这已经是十分丰厚了，须知，此时一个普通农村家庭一年的开支都是达不到四两银子的，另外，清政府一个正七品官员一个月的俸禄也只是四两左右但额外还会发粮食，比起曾国藩，夏华更加阔气、豪爽、大方，根据他颁布的军饷明文规定：

太平军士兵每月军饷五两白银整

班长每月军饷十两白银，副班长两

排长每月军饷十五两白银，副排长十二两

连长每月军饷二十五两白银，副连长二十两

营长每月军饷五十两白银，副营长四十两

团长每月军饷一百两白银，副团长十两

旅长每月军饷一百五十两白银，副旅长一百二十两

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