此时，已经是巫妖二族对立之时，于女娲而言，她是痛苦的：

妖族于她是父是母，但妖族怪她不告知成圣方法，在巫妖争执时不帮扶妖族；

人族于她是子是女，子女不敢怪父母，但是埋怨还是有的，甚至人族饱受其他种族欺压，存在的意义是什么，难道就是为了成就女娲的圣位吗？

索性女娲两不相帮，巫妖大战后期，鸿钧老祖的小童昊天整顿神界。

后来人的妹妹后土，也身化地狱，完善轮回法则。

兄长伏羲争夺人族气运成了黄帝后再算不出在哪里。

又有水神共工败于火神祝融，怒触不周山，神界凋零。

女娲心凉了。

女娲索性将息壤用先天炙火炼制，融入自己对法则的领悟。

因为与大地密切相关，五行法则占据上风，得到五彩石。

补了天之后，索性以身亡为遮掩，离开了破碎的洪荒大陆。

巫妖二族本体强大，有吞天噬地之能，毕竟法则残留融于血脉之中。

不过再强大能强过祖龙元凤？能预知未来的始麒麟？答案是不能的。

妖族掌天，巫族执地。

亿万生灵受二族保护的同时，也受到二族的压迫。哪里有压迫，哪里就有反抗。

同时，洪荒大陆所能使用的先天至宝，后天至宝都被顶端大能瓜分，修炼资源并非无穷无尽，当元凤涅槃轮回初现之时，天地生灵便再也没有永生不灭的存在，纵然是神兽也仅仅是寿命长久，没有足够能量时要么陷入沉睡，要么不能发挥本体力量。

资源之战再次掀起，不同于龙凤大战，巫妖大战不仅仅是天道的自我清理和种族的生存之战，同时掺杂了人族的算计、天地的掌控权力：

【妖族有东皇太一（执掌混沌钟）、帝俊、羲和、望舒、妖师鲲鹏，以及众多太古洪荒妖神（十二妖神：商羊、陆吾/开明兽、计蒙、英招、白泽、穷奇、甪端、钦原、鬼车、毕方、九婴、重明鸟），凭借周天星斗大阵守护天庭（后期洪荒小说大多设定女娲心系妖族，五圣围堵娲皇宫）。

剩余十大祖巫、大巫九凤和另一位强横古大巫一同，运转十二都天神煞大阵，对抗妖族摆下的周天星斗大阵，以阵破阵。

由于十二祖巫没有聚齐，无法凝聚出接近于天道圣人肉身出手的威力（肉身强度无限接近圣人，但终究不如圣人，且无圣人神通），而东皇太一又执掌东皇钟（混沌钟），帝俊执掌屠巫剑（戮巫剑：巫妖战前，羲皇遭祖巫围杀身陨，娘娘取混沌魔神伏羲尸首，在炼天炉中炼制而成），巫妖双方斗了个旗鼓相当。

众大巫也与众妖族众人捉对厮杀。

最终，双方发死力，双双破败，众祖巫合身自爆，与东皇太一、帝俊等人同归于尽。

其中，妖师鲲鹏偷取河图、洛书，逃之夭夭。

经此一战，太一、帝俊与祖巫俱身损，妖神、大巫死伤无数。

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