终不然只管混账过去，费坏朝廷许多钱粮，要东江何用？

本部院披肝沥胆，与你谈了三日，只道你回头是迟也还不迟。

那晓得你狼子野心，总是一片欺诳到底。

目中无本部院犹可，方今圣天子英武天纵，国法岂容得你？”

语毕，袁崇焕向西叩头，请皇命，下令拿下毛文龙，剥去冠裳。

毛文龙尚不认罪，一直倔强反抗，不肯就缚。

袁崇焕又大声呵责：“你道本部院是个书生，本部院是朝廷一个首将。

你这毛文龙有应斩十二罪，你可知么？！

兵马钱粮不经查核，夜郎自据，横行一方，专制孰甚，一当斩；

说谎欺君，杀降诛顺，全无征战，却占首功，欺诳孰甚，二当斩；

刚愎撒泼，无人臣礼，牧马登州，问鼎日下，大逆不道，三当斩；

每岁侵饷银数十万，每月给米三斗五升，克减军粮，四当斩；

私开马市，潜通岛夷，五当斩；

命姓赐氏，不出朝廷走使，舆台滥给札付，犯上无等，六当斩；

劫掠商人，夺船杀命，积岁所为，劫赃无算，身为盗贼，七当斩；

部将之女收而为妾，民间之妇没而为奴，好色诲淫，八当斩；

逃难辽民，不容渡海，给椀米，令往掘参，畏不肯往，饿死岛中，草菅民命，九当斩；

拜魏忠贤为父，迎冕像于岛中，至今陈汝明一夥，盘跟京师，交结近侍，十当斩；

铁山之败，丧军无数，逃窜皮岛，掩败为功，十一当斩；

开镇八年，不复寸土，观望养寇，十二当斩。

这都是你的罪案。今日杀了毛文龙，本部院若不能恢复全辽，以还朝廷，愿试尚方以偿尔命！”

袁崇焕又宣言于毛文龙属下众官道：“毛文龙这十二罪，你们说该杀不该杀，若本部院屈杀了他，你们上来就杀我！”

说完，摆出“延颈就戮”的姿态。

众官皆相顾失色，叩头哀告。

毛文龙明白袁崇焕所列罪状多是实话，“神颓魄丧，不复能言”，只是跪在地上叩头求饶：“文龙自知死罪，只求老爷幵恩”。

袁崇焕怒斥道：“你不知国法久了，若不杀你，这一块土，非上所有”。

随即向西叩头，请持尚方剑来，令水营都司赵可教、何麟监斩，令旗牌官张国柄执拿尚方剑，斩毛文龙首级于帐前。

又分付毛文龙亲人备好棺木，安葬毛文龙尸骸。

当时围外的毛文龙亲信兵丁汹汹欲乱，见袁崇焕号令威严，身边亲兵又严阵以待，都不敢轻举妄动。

袁崇焕唤令东江各官来见，说道：“本部院今日只斩文龙一人，以安海外兵民，这是杀人安人。尔各将照旧供职，各复原姓，为国报效，罪不及尔，不必忧疑”。

接着开始安排东江善后事宜：

“分付将东江兵二万八千分为四协，杀其父用其子毛承禄管一协，用旗鼓徐敷奏管一协，还有两协，东江众官请游击刘兴作、副将陈继盛二员管之。

又分付东江官兵久被毛镇剥削，将带来银十万，赏各岛官兵，每员赏银三两。

唤赏功官同东江旗鼓冯有时，将见在官兵一千八百员名，共赏银一千四百两，以彰信赏必罚之意。

其余四协兵，照例给予。

又谕冯旗鼓速差人往旅顺宣抚，又谕将毛帅印缴来，东江事权著陈继盛代管，俟那一协建功，即将此印题授与他。

谕毕，离岛登州发牌，一面安抚各岛军民，票行登州游击尹继何速备坚船二十只侯用。

又行文毛承柞，先令安抚，后有所欠商银，著即办偿还。

又使小帖云户部委官陈越札授守备，督运各岛粮饷，又发稿写四协札付。

又差官陈岛中冤狱，并掳来各商船只，俱即查报。有商人王从义等数十名讫。

至夜静，有徽州朱相公拂缨上船，叙坐至二更方散。

初六日，命具祭礼，督师亲诣文龙棺前，拜云‘昨日斩你，是朝廷的法。今日祭你，是本部院的情’。

遂下泪，各将官俱下泪感叹。

初七日，登山试演。

初八日，差中军至皮岛取尚方剑并同符验。

初九日早，往旅顺，官军迎接。

布置毕，初十日晚开船，十一日抵达宁远。

是日，顺风大作，十二日早过江进城毕”。（《崇祯长编》卷23）

回宁远之后，袁崇焕呈上著名的斩帅题本，题称“恭报岛帅逆形昭著，机不容失，便宜正法，谨席藁待罪”。

得到毛文龙被袁崇焕擅杀的消息，崇祯的震惊是必然的。

《明史》卷259《袁崇焕传》称，“帝骤闻，意殊骇，念既死，且方倚崇焕，乃优旨褒答”。

这个说法基本上反映了崇祯的心态。

一方面，毛文龙是有该诛之罪，藉由斩帅，东江的离心势力遭到沉重的打击，恶性膨胀的将权也得到压制，明廷得以控制东江，对此崇祯当然欣慰，毕竟东江问题一直让他非常担忧。

正如夏允彝在《幸存录》卷上说“崇焕杀文龙，上亦甚喜，褒谕备至，不嫌其矫制”。

又《明史》卷251《钱龙锡传》云“时文龙拥兵自擅，有跋扈声，崇焕一旦除之，即当宁不以为罪也”。

又《崇祯实录》卷2云“上以文龙骄悖，命崇焕安心任事，且嘉谕之”。

但另一方面，纵使毛文龙其迹该诛，也不应该由袁崇焕操刀。

袁崇焕虽然被授予便宜行事之权，但是生杀大权须禀明于朝廷，何况杀戮的又是大将？

崇祯对于袁崇焕如此大胆的侵权擅杀行为一直心存芥蒂，逮捕袁崇焕时仍执以为词，其后袁崇焕被罗织罪名，擅权斩帅是其中大款。

另外，正如《明史》本传所说，当时崇祯倾心倚任袁崇焕，责以按期收复辽东，只要斩帅有利于收复失地，崇祯可以包容袁崇焕的逾制越权。

正因如此，崇祯对于斩帅的回应是积极的支持。

当时他召问辅臣商量此事，韩爌请求“降诏慰崇焕，一如其所更置”，崇祯表示同意。

此斩帅题本奉圣旨：“毛文龙悬跟海上，糜饷冒功，朝命频违，节制不受，近复提兵进登，索饷要挟，跋扈叵测，通夷有迹，犄角无资，掣肘兼碍，卿能周虑猝图，声罪正法，事关封疆安危，阃外原不中制，不必引罪，一切处置事宜，遵照敕谕行，仍听相机行”。

为了让袁崇焕安心任事，崇祯特地让首辅韩爌拟旨宣谕兵部：

“朕以边事付督师袁崇焕，阃外军机，听以便宜从事。

乃岛帅毛文龙，悬军海上，开镇有年，以牵制为名，全无功效，剿降献捷，欺诳朝廷，器甲会粮，囊耗军国，而且刚愎自用，节制不受，近乃部署多兵，来登索饷，咆嚣跋扈，显著逆形。

崇焕目击危机，躬亲正法，责其十二罪状，死当厥辜，决策弭变，自是行军纪律，具疏待罪，已奉明论，一切善后事宜，委任道将。

仍榜示东江各岛，元恶既正典刑，逆节尚未及发，姑从宽议，亲属子弟及冒姓诸人，悉从赦宥，将领量才授任，军士清伍给粮，辽民壮者入伍，老者纵归，朝鲜声援相联，亦与移谕，其区画未尽事务，听督师相机布置。

向闻文龙贿交中外，流布蜚语，今事迹既彰，群疑可释，其在京潜伏党与，所司捕辑，尔部即传谕知之”（《崇祯长编》卷23）

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